Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRHP20396 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRHP20396 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRHP20396 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRHP20396 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRHP20396 MIR137HG-205ENST00000634594 3586 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRHP20396 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TRHP20396 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 ASCC1-202ENST00000317168 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 ZNF385B-203ENST00000409692 2109 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 ZNF317-202ENST00000360385 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 DPF3-203ENST00000541685 4077 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 ZNF587B-201ENST00000442832 3339 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TRHP20396 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 LRRC37BP1-203ENST00000417404 4742 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 ENOX1-AS1-201ENST00000444442 3907 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 NHLRC3-202ENST00000379600 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 HBS1L-205ENST00000367837 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 AL008726.1-201ENST00000607703 569 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC099753.1-201ENST00000634947 2118 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 ACSBG2-206ENST00000588485 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 CD302-202ENST00000429078 3803 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 MCTP1-202ENST00000429576 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 MYO1A-201ENST00000300119 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TRHP20396 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TRHP20396 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRHP20396 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
TRHP20396 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms