Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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