Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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