Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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