Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AP002358.1-201ENST00000399003 2805 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 HHAT-204ENST00000413764 3575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RSRC2-201ENST00000331738 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 ADGRF2-201ENST00000296862 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 TRBV7-4-201ENST00000390369 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AL450468.1-201ENST00000415166 450 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC005840.2-201ENST00000447193 355 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 LINC02022-201ENST00000448129 635 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RN7SL685P-201ENST00000476271 298 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RN7SL464P-201ENST00000492743 297 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 EGFLAM-AS1-201ENST00000508986 331 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC008737.3-201ENST00000601661 221 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 PROX1-AS1-221ENST00000615085 673 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 CCDC14-203ENST00000409697 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 ZNF610-207ENST00000601151 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 OVCH1-201ENST00000318184 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 LCA5-203ENST00000467898 2894 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 ARHGEF9-234ENST00000637557 4775 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 ATP1A2-202ENST00000392233 3338 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 LINC01721-201ENST00000457274 2376 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AL139811.2-201ENST00000373465 1630 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 MSL3-203ENST00000361672 2256 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 WISP3-204ENST00000368666 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 PARP9-201ENST00000360356 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 FAM217B-201ENST00000358293 5152 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC108099.1-201ENST00000564402 3258 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 CNGA2-201ENST00000329903 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 PPARGC1A-206ENST00000507380 2385 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 MYADML-203ENST00000491596 951 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC003991.2-201ENST00000520993 576 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 SNRPCP14-201ENST00000524498 205 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AC090707.1-201ENST00000528795 396 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 ZNF503-AS1-205ENST00000530606 549 ntTSL 4 BASIC9.12□□□□□ -0.95
CACNB1Q02641 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms