Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRGP23470 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms