Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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C4BP0C0L5 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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C4BP0C0L5 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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C4BP0C0L5 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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C4BP0C0L5 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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C4BP0C0L5 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
C4BP0C0L5 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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