Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SPIDR-205ENST00000518060 482 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01605-202ENST00000519738 733 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FTH1-203ENST00000529191 530 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012653.1-201ENST00000558410 931 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXC2-AS1-201ENST00000563280 319 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100791.1-201ENST00000570408 324 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AD000671.1-201ENST00000591613 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM91-214ENST00000604123 757 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026355.3-201ENST00000611065 727 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H4G-201ENST00000611444 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.72-201ENST00000617458 278 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 pRNA.4-201ENST00000620973 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GAGE2E-201ENST00000621907 403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005943.2-201ENST00000624421 148 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIBP2-224ENST00000533792 3003 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 YAF2-219ENST00000555248 5095 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A4-209ENST00000572037 3620 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF24-202ENST00000402558 6131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OXNAD1-201ENST00000285083 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BABAM2-202ENST00000344773 1852 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IFIH1-201ENST00000263642 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TIAM2-212ENST00000529824 5262 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK10-201ENST00000258390 7260 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ESPL1-201ENST00000257934 6623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATCAY-205ENST00000600960 2904 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LRIT2-201ENST00000372113 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CHMP1B-201ENST00000526991 3054 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NRXN3-215ENST00000557594 3381 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01391-203ENST00000495287 3538 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EFL1-201ENST00000268206 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MRS2-204ENST00000443868 3980 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BX005040.3-201ENST00000611332 1988 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590491.1-201ENST00000611916 1988 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BX005214.3-201ENST00000615174 1988 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PIPSL-202ENST00000489875 2733 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AK7-201ENST00000267584 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT18P59-202ENST00000534728 3338 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMO-207ENST00000611338 3635 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RRN3-201ENST00000198767 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PSPN-202ENST00000597721 3911 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PPARGC1B-204ENST00000403750 3146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms