Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LRRIQ1Q96JM4 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LRRIQ1Q96JM4 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms