Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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