Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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