Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HMGN3Q15651 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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