Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL4BQ13620 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms