Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 FAM13A-218ENST00000511976 3579 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 UBE2V2-207ENST00000523111 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ZSCAN9-207ENST00000531979 1601 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU1-11P-201ENST00000383975 164 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AL121908.1-201ENST00000443055 668 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
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