Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COPS7AQ9UBW8 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COPS7AQ9UBW8 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COPS7AQ9UBW8 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
COPS7AQ9UBW8 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COPS7AQ9UBW8 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COPS7AQ9UBW8 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COPS7AQ9UBW8 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COPS7AQ9UBW8 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COPS7AQ9UBW8 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COPS7AQ9UBW8 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.2 ms