Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TM6SF1Q9BZW5 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms