Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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