Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ANKRD42Q8N9B4 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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