Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC005230.1-201ENST00000555418 285 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC087639.1-201ENST00000560974 920 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC090415.1-201ENST00000581877 847 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF85-206ENST00000596476 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC008622.1-201ENST00000597106 284 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 U3.50-201ENST00000611947 228 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC239803.3-201ENST00000614663 494 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MTRF1-204ENST00000430347 557 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL109945.1-201ENST00000448134 687 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TXNP3-201ENST00000454560 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 OR7E83P-201ENST00000511021 970 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC117372.1-201ENST00000548633 620 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 BICRA-AS1-201ENST00000598376 547 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ANKRD39Q53RE8 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms