Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CSPP1Q1MSJ5 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms