Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
IMPG1Q17R60 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms