Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms