Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
USF2Q15853 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
USF2Q15853 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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