Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
RUNX3Q13761 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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