Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PMS2P11Q13670 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms