Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL3Q13618 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms