Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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