Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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