Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ARFIP2P53365 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms