Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ATMINO43313 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ATMINO43313 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ATMINO43313 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ATMINO43313 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
ATMINO43313 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC099524.1-206ENST00000568131 407 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AL590560.2-201ENST00000608430 732 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
ATMINO43313 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
ATMINO43313 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
ATMINO43313 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ATMINO43313 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
ATMINO43313 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
ATMINO43313 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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