Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SHOC2Q9UQ13 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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