Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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LRRIQ1Q96JM4 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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LRRIQ1Q96JM4 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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LRRIQ1Q96JM4 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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LRRIQ1Q96JM4 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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LRRIQ1Q96JM4 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
LRRIQ1Q96JM4 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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