Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SEC23BQ15437 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms