Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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BRD3Q15059 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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BRD3Q15059 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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BRD3Q15059 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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BRD3Q15059 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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BRD3Q15059 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRD3Q15059 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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