Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB39AQ14964 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RAB39AQ14964 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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