Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL4A6Q14031 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL4A6Q14031 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms