Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CNGB1Q14028 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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