Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CACNA1SQ13698 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
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