Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TCOF1Q13428 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TCOF1Q13428 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TCOF1Q13428 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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TCOF1Q13428 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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TCOF1Q13428 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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TCOF1Q13428 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TCOF1Q13428 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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