Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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