Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CENPFP49454 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CENPFP49454 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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CENPFP49454 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CENPFP49454 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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CENPFP49454 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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CENPFP49454 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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CENPFP49454 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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CENPFP49454 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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CENPFP49454 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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CENPFP49454 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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CENPFP49454 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CENPFP49454 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CENPFP49454 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CENPFP49454 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CENPFP49454 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CENPFP49454 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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