Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HOXD13P35453 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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