Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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