Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPREP23469 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPREP23469 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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PTPREP23469 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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PTPREP23469 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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PTPREP23469 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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PTPREP23469 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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