Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms