Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PKHD1P08F94 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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