Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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ERVV-1B6SEH8 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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ERVV-1B6SEH8 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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ERVV-1B6SEH8 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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