Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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