Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RUNX2Q13950 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RUNX2Q13950 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms