Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms